Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trim30dE9PWL0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Trim30dE9PWL0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trim30dE9PWL0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trim30dE9PWL0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms