Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30bE9PVL6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim30bE9PVL6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim30bE9PVL6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim30bE9PVL6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim30bE9PVL6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms