Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc175E9PVB3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc175E9PVB3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc175E9PVB3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc175E9PVB3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms