Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Syde2E9PUP1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Syde2E9PUP1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Syde2E9PUP1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Syde2E9PUP1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Syde2E9PUP1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117 ms