Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms