Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc8D3YZV8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc8D3YZV8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc8D3YZV8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc8D3YZV8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms