Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930444P10RikD3YUR1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930444P10RikD3YUR1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930444P10RikD3YUR1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930444P10RikD3YUR1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930444P10RikD3YUR1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms