Protein–RNA interactions for Protein: D3YUJ3

Ccnyl1, Cyclin Y-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnyl1D3YUJ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccnyl1D3YUJ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccnyl1D3YUJ3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnyl1D3YUJ3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnyl1D3YUJ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms