Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Catsperg2C6KI89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Catsperg2C6KI89 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Catsperg2C6KI89 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Catsperg2C6KI89 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms