Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb5B5X0E4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcb5B5X0E4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb5B5X0E4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb5B5X0E4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms