Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pnldc1B2RXZ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pnldc1B2RXZ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pnldc1B2RXZ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms