Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Siah3B2RWG3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Siah3B2RWG3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Siah3B2RWG3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms