Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rd3lB2RV38 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rd3lB2RV38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rd3lB2RV38 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rd3lB2RV38 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms