Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem235B1AQL3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem235B1AQL3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem235B1AQL3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem235B1AQL3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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