Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al2bA9Z055 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al2bA9Z055 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
H2al2bA9Z055 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al2bA9Z055 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al2bA9Z055 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
H2al2bA9Z055 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al2bA9Z055 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2al2bA9Z055 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al2bA9Z055 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al2bA9Z055 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2al2bA9Z055 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms