Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap221A9Q751 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Cfap221A9Q751 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cfap221A9Q751 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cfap221A9Q751 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms