Protein–RNA interactions for Protein: A7XV14

Skint11, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint11A7XV14 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Skint11A7XV14 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Skint11A7XV14 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Skint11A7XV14 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Skint11A7XV14 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint11A7XV14 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint11A7XV14 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint11A7XV14 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint11A7XV14 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint11A7XV14 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Skint11A7XV14 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms