Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttll11A4Q9F4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttll11A4Q9F4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll11A4Q9F4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll11A4Q9F4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms