Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2al1jA2BFR3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2al1jA2BFR3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2al1jA2BFR3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms