Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc43a3A2AVZ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc43a3A2AVZ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc43a3A2AVZ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms