Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmpd4A2AFR3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmpd4A2AFR3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Frmpd4A2AFR3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmpd4A2AFR3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmpd4A2AFR3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms