Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nlrp1bA1Z198 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nlrp1bA1Z198 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nlrp1bA1Z198 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nlrp1bA1Z198 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms