Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc112A0AUP1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc112A0AUP1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc112A0AUP1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms