Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDK0

3110040M04Rik, Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110040M04RikA0A286YDK0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
3110040M04RikA0A286YDK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110040M04RikA0A286YDK0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
3110040M04RikA0A286YDK0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110040M04RikA0A286YDK0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms