Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUD5

Nup205, Nucleoporin 205, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup205A0A0J9YUD5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nup205A0A0J9YUD5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nup205A0A0J9YUD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nup205A0A0J9YUD5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms