Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1J2

Igkv5-43, Immunoglobulin kappa chain variable 5-43 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Igkv5-43A0A0B4J1J2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms