Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm5538W4VSP6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5538W4VSP6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5538W4VSP6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms