Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm4T1NXB5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms