Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Top3bQ9Z321 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms