Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Crlf3Q9Z2L7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Crlf3Q9Z2L7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms