Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Mbd2Q9Z2E1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mbd2Q9Z2E1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms