Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf394Q9Z1D9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf394Q9Z1D9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf394Q9Z1D9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf394Q9Z1D9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf394Q9Z1D9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf394Q9Z1D9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf394Q9Z1D9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf394Q9Z1D9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms