Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Padi3Q9Z184 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Padi3Q9Z184 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms