Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Skp2Q9Z0Z3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms