Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nme3Q9WV85 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nme3Q9WV85 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms