Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpc2Q9R244 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpc2Q9R244 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms