Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sorbs3Q9R1Z8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sorbs3Q9R1Z8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms