Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gpc6Q9R087 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gpc6Q9R087 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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