Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
AmfrQ9R049 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms