Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Copg1Q9QZE5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Copg1Q9QZE5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms