Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ubxn8Q9QZ49 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn8Q9QZ49 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms