Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rdh11Q9QYF1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh11Q9QYF1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rdh11Q9QYF1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh11Q9QYF1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rdh11Q9QYF1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rdh11Q9QYF1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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