Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC8

Epb41l4b, Band 4.1-like protein 4B, mousemouse

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Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4bQ9JMC8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Epb41l4bQ9JMC8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Epb41l4bQ9JMC8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Epb41l4bQ9JMC8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Epb41l4bQ9JMC8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Epb41l4bQ9JMC8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41l4bQ9JMC8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Epb41l4bQ9JMC8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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