Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rabgef1Q9JM13 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rabgef1Q9JM13 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rabgef1Q9JM13 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rabgef1Q9JM13 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rabgef1Q9JM13 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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