Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Higd1aQ9JLR9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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