Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms