Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Hmgn5Q9JL35 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hmgn5Q9JL35 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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