Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cnot9Q9JKY0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cnot9Q9JKY0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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