Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trem1Q9JKE2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms