Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Msgn1Q9JK54 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msgn1Q9JK54 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms